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重组RNase R

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RNase R是采用大肠杆菌表达的来源于大肠杆菌的rnr基因,是一种依赖于Mg2+的3’-5’ 核糖核酸外切酶,可以高效的降解绝大部分线性RNA分子,但不能消化套索或环状结构的RNA,带有少于7个核苷酸3’ 凸出端的双链RNA,以及部分具有复杂结构的RNA。该酶可以通过降解混合RNA中的线性RNA,从而提高环状RNA的丰度,达到富集环状RNA的目的。此外,也可通过65°C加热20分钟的方式灭活酶活性。

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产品描述

RNase R是采用大肠杆菌表达的来源于大肠杆菌的rnr基因,是一种依赖于Mg2+的3’-5’ 核糖核酸外切酶,可以高效的降解绝大部分线性RNA分子,但不能消化套索或环状结构的RNA,带有少于7个核苷酸3’ 凸出端的双链RNA,以及部分具有复杂结构的RNA。该酶可以通过降解混合RNA中的线性RNA,从而提高环状RNA的丰度,达到富集环状RNA的目的。此外,也可通过65°C加热20分钟的方式灭活酶活性。


用途

环状RNA的富集与鉴定


优势

(1) 可降解线性RNA,但不易降解环状RNA

(2) 降解效率高,一般30分钟就可以降解大多数的线性RNA


信息

(1) 存储液: 50mM Tris-HCl, 200mM NaCl, 1mM DTT, 0.1mM EDTA, 0.1% Triton X-100, 50%甘油,pH=7.5

(2) 储存温度: -20°C


使用方法

在无菌微量离心管中配制以下反应体系:

组分 Volume
1 × RNase R Reaction Buffer
20 uL
RNA样本 1 ug
RNase R 2-4 U
DEPC 水 Up to 20 uL

注意事项:

1. RNase R 的活性需要 0.1-1.0 mM Mg2+

2. 随底物 RNA 的增加,可适当延长消化时间和增加酶量;

3. RNA样本中EDTA含量可能会影响 RNase R 的活性;

4. 消化条件:37℃反应10 min-30 min;

5. 失活条件:70℃孵育10 min可使酶失活。


资料下载

重组RNase R说明书


参考文献

[1] Abudureyimu Abula, et al. Nucleic Acids Res. Molecular mechanism of RNase R substrate sensitivity for RNA ribose methylation

[2] Xue Liu, et al. Minerva Med. CircRNA ACAP2 induces myocardial apoptosis after myocardial infarction by sponging miR-29

[3] Yatong Wang, et al. Molecules. A Novel Cold-Adapted and Salt-Tolerant RNase R from Antarctic Sea-Ice Bacterium Psychrobacter sp. ANT206

[4] Shaheen Sulthana, et al. Appl Environ Microbiol. rnr gene from the antarctic bacterium Pseudomonas syringae Lz4W, encoding a psychrophilic RNase R

[5] Xavier Charpentier, et al. J Bacteriol. Loss of RNase R induces competence development in Legionella pneumophila

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