RNase R是采用大肠杆菌表达的来源于大肠杆菌的rnr基因,是一种依赖于Mg2+的3’-5’ 核糖核酸外切酶,可以高效的降解绝大部分线性RNA分子,但不能消化套索或环状结构的RNA,带有少于7个核苷酸3’ 凸出端的双链RNA,以及部分具有复杂结构的RNA。该酶可以通过降解混合RNA中的线性RNA,从而提高环状RNA的丰度,达到富集环状RNA的目的。此外,也可通过65°C加热20分钟的方式灭活酶活性。
产品描述
RNase R是采用大肠杆菌表达的来源于大肠杆菌的rnr基因,是一种依赖于Mg2+的3’-5’ 核糖核酸外切酶,可以高效的降解绝大部分线性RNA分子,但不能消化套索或环状结构的RNA,带有少于7个核苷酸3’ 凸出端的双链RNA,以及部分具有复杂结构的RNA。该酶可以通过降解混合RNA中的线性RNA,从而提高环状RNA的丰度,达到富集环状RNA的目的。此外,也可通过65°C加热20分钟的方式灭活酶活性。
用途
环状RNA的富集与鉴定
优势
(1) 可降解线性RNA,但不易降解环状RNA
(2) 降解效率高,一般30分钟就可以降解大多数的线性RNA
信息
(1) 存储液: 50mM Tris-HCl, 200mM NaCl, 1mM DTT, 0.1mM EDTA, 0.1% Triton X-100, 50%甘油,pH=7.5
(2) 储存温度: -20°C
使用方法
在无菌微量离心管中配制以下反应体系:
组分 | Volume |
1 × RNase R Reaction Buffer |
20 uL |
RNA样本 | 1 ug |
RNase R | 2-4 U |
DEPC 水 | Up to 20 uL |
1. RNase R 的活性需要 0.1-1.0 mM Mg2+;
2. 随底物 RNA 的增加,可适当延长消化时间和增加酶量;
3. RNA样本中EDTA含量可能会影响 RNase R 的活性;
4. 消化条件:37℃反应10 min-30 min;
5. 失活条件:70℃孵育10 min可使酶失活。
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